ويباشر مهامه عن طريق الأقسام التالية :

أ‌-    قسم الرقابة الإشعاعيــــــــــــة . 

ب‌-   قسم التراخيص والأدونــــــــات . 

ت‌-   قسم الآمان النووي والضمانات . 

ث‌-   قسم التقييم والدراســــــــــــات . 

أ‌)      قسم الرقابة الإشعاعية: 

ويتولى القيام بالمهام التالية : 

 -   ضمان الإلتزام بتطبيق اللوائح الدولية والمحلية ذات العلاقة بالسلامة والوقاية الإشعاعية.

-    إقتراح سياسات وطنية وآليات تنفيذية للتصرف الآمن في المصادر المشعة بعد الإنتهاء من إستعمالها .

-    حصر ودراسة جميع المنشآت التي لها علاقة بمزاولة الأنشطة الخاصة بإستخدام المصادر المشعة والمحتوية على تجهيزات ومعدات يكون إستعمالها سببا في إنبعاث إشعاعات مؤينة و التأكد من توفر شروط السلامة والوقاية بالأماكن التي توجد بها تلك المصادر .

-    متابعة جميع ما يتعلق بالمصادر المشعة المفقودة ومجهولة المصدر .

-    إعداد قاعدة بيانات لتسجيل وتصنيف ومتابعة المصادر المشعة داخل الجماهيرية .

-    تبادل المعلومات مع الجهات ذات العلاقة عن المصادر المشعة المهربة عبر الحدود حول العالم .

-    مايسند للقسم من أعمال.

 ب‌)   قسم التراخيص والأدونات:

ويتولى القيام بالمهام التالية :

 -    إصدار إرشادات بشأن شكل ومحتوى الوثائق التي تحدد المبادئ والمعايير التي يجب على طالب التصريح أو الترخيص تقديمها للمكتب .

-     النظر في طلبات التراخيص وتقييمها وفقا لإجراءات محددة و واضحة لغرض الترخيص للمنشآت النووية والأنشطة ذات العلاقة .

-    وضع آلية التراخيص والمتابعة أثناء نقل وإستخدام وتخزين المواد النووية والمصادر المشعة وكذلك إجراءات ما بعد الإنتهاء من الإستخدام بالشكل الذي يضمن سلامة المواطن والبيئة بالجماهيرية .

-     القيام بمهام التفتيش والإنفاذ لإلزام المرخص له بتطبيق لوائح و نظم السلامة و الامان الاشعاعي.

-     تفعيل دور اللجنة الوطنية من أخطار الإشعاعات المؤينة حسب القانون رقم (2) لسنة 1982 م فيما يتعلق بمنح التراخيص.

-     مايسند للقسم من أعمال.

ت)قسم الأمان النووي والضمانات:

   ويتولى القيام بالمهام التاليـــــة:

 -   ضمان أمن وأمان المواد النووية و المنشآت النووية .

-    ضمان مراقبة نقل المواد النووية والمصادر المشعة وتخزينها والتعامل معها وفقا للمعايير الأمنية المعتمدة .

-    متابعة تنفيذ الإتفاقيات النافذة ذات العلاقة بالامان النووي و الضمانات الدولية ذات العلاقة بمهام المكتب .

-    اعداد نظام وطني للحسابات والتحكم في المواد النووية بالجماهيرية.

-    مراجعة المعلومات والبيانات المقدمة من المشغلين بما في ذلك طرق التشغيل للمفاعلات والمرافق النووية لتقييمها والتأكد من مطابقتها وفقا للوائح المحلية والدولية ذات العلاقة بالسلامة والأمان النوويين قبل إصدار التصاريح أو الإفراج أو أثناء التشغيل حسب مقتضيات الأحوال .

-    متابعة تطور برامج السلامة والأمان النووي في العالم وتطبيق ما يتلائم منها داخل الجماهيرية العظمى .

-    اقتراح سياسات وطنية وآليات تنفيذية للتصرف الآمن في النفايات المشعة بالتنسيق مع إدارة الوقود ومعالجة النفايات المشعة .

-    مايسند للقسم من أعمال.

 ث) قسم التقييم والدراسات:

ويتولى القيام بالمهام التالية :

 -    متابعة وتقييم النظام الوطني للحسابات والتحكم في المواد النووية .

 -    مراجعة وتقييم تقارير  تحليل السلامة الميدانية والنهائية وكذلك مراجعة الوثائق المتعلقة بسلامة عمل المنشآت النووية بالتنسيق مع قسم الترخيص والأدونات .

-     الإشراف على الأنشطة العلمية وإقتراح ورش العمل والدورات التدريبية في المجالات ذات العلاقة بعمل المكتب .

-     بدل الجهود لرفع درجة التوعية الإشعاعية للمواطنين والعاملين في الحقل الإشعاعي من أخطار الإشعاعات المؤينة وتأثيراتها بالتنسيق مع من يلزم.

-     دراسة متطلبات الرقابة النووية المتعلقة بالمفاعلات والمحطات النووية لتوليد الطاقة .

-     إعداد التقارير الخاصة بتطبيق الاتفاقيات الدولية في مجال السلامة الاشعاعية و الامان النووي.

مايسند للقسم من أعمال.