وتباشر مهامها عن طريق الأقسام التالية:

 أ‌-          قسم دعم و تطوير التطبيقات الإشعاعية .

ب‌-          قسم التوعية الإشعاعية والوقائية .

جـ-          قسم المسوحات والقياسات الإشعاعية .

أ‌)      قسم دعم و تطوير التطبيقات الإشعاعية:

 ويتولى القيام بالمهام التالية :

1-  تشجيع التوسع في تطبيقات و استخدام تكنولوجيا الإشعاع للأغراض السلمية داخل الجماهيرية .

2-  القيام بتقديم المساعدات الفنية الخاصة بإقتناء تقنيات تكنولوجيا الإشعاع للإستخدامات التنموية بالجماهيرية .

3-  إعداد التقارير الدورية والسنوية التي تعكس نشاط الإدارة .

4-  المشاركة في إدخال خدمات تعقيم المنتجات الزراعية و الطبية والصناعية بإستخدام المعجلات الالكترونية ومصادر أشعة جاما .

5-  مايسند للقسم من أعمال.

  ب‌)  قسم التوعية الإشعاعية والوقائية:

ويتولى القيام بالمهام التالية :

 نشر الوعي الإشعاعي بين العاملين وأفراد الجمهور على مستوى الجماهيرية حول إستخدام المصادر المشعة من خلال وسائل الاعلام المختلفة و المتاحة.

جـ)  قسم المسوحات و القياسات الإشعاعية:

ويتولى القيام بالمهام التالية:

1-   تنفيذ بعض الاختصاصات المنصوص عليها في القانون رقم (2) لسنة 1982مسيحي ولائحته التنفيذية بالتنسيق مع مكتب الرقابة الإشعاعية والأمان النووي خاصة فيما يتعلق بالتعرض الإشعاعي المهني .

2-   القيام بأعمال المسح الإشعاعي والقياسات الميدانية للمرافق والمنشآت والأماكن المتوقع أن تحتوي على مصادر مشعة ومواد وتجهيزات تنبعث منها إشعاعات مؤينة .

3-   التنسيق لإعداد الدراسات والبحوث المتعلقة بالتعرض الإشعاعي المهني .

4-   التنسيق مع مكتب الرقابة الإشعاعية والآمان النووي لمتابعة التقيد بالنظم واللوائح السارية فيما يتعلق بإستخدام المواد المشعة بالجماهيرية .

5-   إجراء القياسات الميدانية اللازمة لتقدير الخلفية الإشعاعية الطبيعية على مستوى الرقعة الجغرافية للجماهيرية بالتنسيق مع الجهات ذات العلاقة.

6-   تقديم الخدمات الخاصة بقياس مستويات التعرض الإشعاعي المهني عند الطلب .

7-   الإشراف وتشغيل معمل المسح الإشعاعي الكلي للجسم.

8-   التنسيق مع المعامل و المختبرات المختلفة بالمراكز التابعة للمؤسسة لتنفيذ أعمال الادارة .