وتباشر مهامها عن طريق الأقسام التالية :

أ‌-    قسم التخطيــــــط . 

ب‌-   قسم المشروعات . 

ت‌-   قسم المتابعة و ضمان الجــــــــودة . 

أ‌-      قسم التخطيط : 

    ويتولى القيام بالمهام التالية:

.    إعداد مقترح الخطط التنفيذية لعمل المؤسسة وفق الإستراتيجية المعتمدة.

·    التنسيق مع الإدارات والمكاتب والمراكز التابعة للمؤسسة لوضع منهجية واسس خطط العمل بالمؤسسة . 

·    وضع الخطط والبرامج اللازمة لتأسيس البنية التحتية لإدخال الطاقات ذات العلاقة بعمل المؤسسة  

·    المساهمة في التخطيط لإمدادية الطاقة مع الجهات المختصة الاخرى بالجماهيرية . 

·    المشاركة في إعداد ميزانية التحول السنوية للمؤسسة بناء على المقترحات المقدمة من الإدارات و المراكز التابعة لها. 

·    إعداد الدراسات حول برامج عمل الادارة وبما يتفق وإستراتيجية المؤسسة .  

·    مراجعة خطط عمل المعامل والمختبرات التابعة للمؤسسة و العمل على تطويرها . 

·    إقتراح مشروعات جديدة وتطوير كفاءة المشروعات القائمة . 

·    مايسند للقسم من أعمال. 

ب‌)  قسم المشروعات:

          ويتولى القيام بالمهام التالية:

-    إعداد دراسات الجدوى الفنية والإقتصادية للمشروعات ذات العلاقة بالتعاون مع الإدارات المختصة.

-    المشاركة في إجراءات لجان الممارسة و الترسية  بالتعاون مع إدارة الشئون الفنية.

-    تحديد متطلبات تنفيذ المشروعات بالتنسيق مع الإدارات والجهات المختصة بالمؤسسة.

-    إعداد المواصفات الفنية وكراسة شروط التعاقد والرسومات والتصاميم الخاصة بالمشروعات بالتعاون مع الجهات ذات العلاقة.

-    المشاركة في إعداد عقود تنفيذ المشروعات المعتمدة.

-    متابعة تنفيذ المشروعات مع الإدارات والأقسام المختصة بالمؤسسة .

-    إعداد قاعدة بيانات فنية عن الجهات و الشركات المتخصصة والتي تمتلك القدرة على تنفيذ مشاريع و إنشاءات ذات طبيعة نووية إشعاعية.

-    مايسند للقسم من أعمال.

ج‌)   قسم المتابعة و ضمان الجودة:

ويتولى القيام بالمهام التالية:

-    إرساء نظام الجودة في كافة الأنشطة لتحسين مستوى أداء الجهات التابعة للمؤسسة .

-    إعداد الخطط لتنفيذ سياسات وأهداف وبرامج ضمان الجودة  لغرض تطبيقها بإدارات ومراكز المؤسسة المختلفة .

-    وضع معايير قياس الأداء لكافة انشطة المؤسسة .

-    إقتراح الآليات المناسبة لتقييم اداء الموظفين وإعداد النماذج المناسبة لذلك .

-    التأكد من إتباع المعايير والمواصفات القياسية المعتمدة عند إقتراح مشاريع جديدة من قبل الإدارات والأقسام المختصة بالمؤسسة .

-    إعداد دراسات تحليلية عن الانشطة و المشروعات المنفذة وتقديم مقترحات لتحسين وتطوير الاداء بالتعاون مع الجهات والمراكز ذات العلاقة بالمؤسسة .

-    العمل على تطبيق نظام الجودة في المختبرات والمعامل والمنشآت التابعة للمؤسسة والمراكز التابعة لها .

-    إعداد التقارير الفنية الدورية والسنوية عن نشاطات المؤسسة .

-    إعداد تقارير المتابعة الخاصة بتنفيذ خطط عمل المؤسسة و اقتراح التوصيات التي تسهم في التطوير وتحسين ادائها.

-    تقديم تقارير دورية عن تقييم الاداء لكافة مجالات العمل بالمؤسسة.

-    تكوين منظومة بيانات عن نشاطات المؤسسة المختلفة .

-    مايسند للقسم من أعمال.